234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0454 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  83.06 
 
 		 124 aa  216  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  48.51 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  45.71 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  47.29 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  46.97 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  48.2 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  45.19 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  48.46 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  43.07 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  43.07 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  50.89 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  43.54 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  37.12 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  42.34 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  42.75 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  42.42 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  93.6  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  41.74 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  41.74 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  40.58 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  37.4 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  33.9 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  38.24 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 163 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.96 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  36.27 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  38.38 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  38.38 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  33.64 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  40.32 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  37.25 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  36.27 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  36.61 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  30.77 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  38.05 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  37.7 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  36.3 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  38.53 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  36.3 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  34.91 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  36.07 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  36.07 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  36.07 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  35.56 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  36.07 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  36.07 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 232 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  36.07 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  36.07 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.91 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  36.51 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  34.91 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  34.07 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  35.96 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  33.72 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  36.17 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  43.21 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  28.06 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  29.35 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>