219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4191 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  83.06 
 
 
147 aa  216  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  49.15 
 
 
162 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  49.15 
 
 
146 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  49.15 
 
 
153 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  48.31 
 
 
132 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  48.31 
 
 
153 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 
155 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  47.46 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 
138 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  44.92 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  48.33 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  45 
 
 
150 aa  94  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  41.8 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  38.6 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  42.5 
 
 
155 aa  87.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  42.5 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  41.49 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  41.49 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  41.49 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  40.86 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  40.86 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  40.59 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  40.59 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  38.95 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  36.56 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  37.37 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  37.37 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  34.31 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  39.66 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  35.96 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  35.96 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  34.26 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  35.09 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  38.39 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  38.61 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  45.24 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  37.4 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  37.36 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  38.61 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  38.61 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  36.11 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  37.62 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
213 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  43.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  43.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  43.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.74 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  43.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  43.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  43.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  43.21 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
181 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  36.52 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
232 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  38.16 
 
 
107 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  41.98 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  35.04 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
161 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  29.36 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  30.93 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  40.54 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>