127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4071 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
128 aa  246  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  89.84 
 
 
128 aa  230  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  72.66 
 
 
135 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  72.66 
 
 
128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  72.66 
 
 
128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  32.8 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  32.8 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  38.95 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  32.2 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  30.51 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.69 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  37 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  29.66 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  29.66 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
232 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  36.96 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  37.84 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  34.78 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  35.11 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
209 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 
142 aa  50.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  33.7 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  39.39 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.31 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  27.87 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  33.9 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  29.7 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  33.7 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  27.18 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
193 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  31.03 
 
 
179 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
183 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.63 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  28.33 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
213 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.66 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
225 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.81 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  40 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0886  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
124 aa  42.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.41 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0015  aromatic compounds catabolism protein  27.03 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  34.41 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  35.64 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3833  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
302 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  33.7 
 
 
154 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  29.73 
 
 
169 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  25.62 
 
 
136 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
161 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>