167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1379 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  55.3 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  49.59 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  44.36 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  40.31 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  45.22 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  44.55 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  38.76 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  40.62 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  40.32 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  41.13 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  40.32 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  44.74 
 
 		 132 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  40.32 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  39.84 
 
 		 148 aa  94.4  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 147 aa  94  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  39.69 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  37.12 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  37.12 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.39 
 
 		 248 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 		 151 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  36.24 
 
 		 238 aa  91.3  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.39 
 
 		 374 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  44.25 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  36.24 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  36.24 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  36.24 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  39.52 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  42.42 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  39.06 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  35.11 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  40.37 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  32.39 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  40.8 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  41.67 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  34.85 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  34.51 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  31.4 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0341  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.54 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  37.19 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  35.16 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  26.32 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  26.45 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  30.28 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  29.82 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.56 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  32.31 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  32.31 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  32.31 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.46 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.46 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  30.95 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  35.23 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.91 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.85 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.41 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  31.06 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  29.23 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>