More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1137 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  287  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  95.1 
 
 
143 aa  248  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  56.72 
 
 
145 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  58.82 
 
 
134 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  55.95 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 
155 aa  90.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
151 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  37.96 
 
 
185 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  37.96 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  51.85 
 
 
146 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  48.91 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  45.37 
 
 
213 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  38.76 
 
 
148 aa  84  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  46.02 
 
 
153 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  46.02 
 
 
132 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  37.59 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  38.6 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  49.38 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  38.79 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  44.23 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  40.74 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  36.19 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  36.94 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  35.9 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  38.52 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  42.5 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  42.48 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.74 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  34.34 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  35.9 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  40.51 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1045  hypothetical protein  31.5 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  38.78 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  35.77 
 
 
169 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  35.4 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  35.4 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  35.4 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  40.45 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  40.45 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  35.65 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  36.11 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  40.45 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  40.22 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  40.22 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  40.22 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  40.22 
 
 
238 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  40.22 
 
 
374 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  40.22 
 
 
248 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  35.77 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  32.61 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.91 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  43.59 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  31.88 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  34.65 
 
 
185 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  30.69 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  43.62 
 
 
176 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
182 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  36.7 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
136 aa  52  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  34.34 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
159 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>