More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3939 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 179 aa  350  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  50.83 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  45.05 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  41.32 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  48.62 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  52.69 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 		 139 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  41.32 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  51.61 
 
 		 169 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  38.35 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  40.5 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  38.84 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  43.22 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  43.22 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 146 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  46.24 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 		 232 aa  87.8  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  41.18 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  36.96 
 
 		 160 aa  85.1  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  35.77 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  36.77 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  38.05 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  41.07 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  37.12 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  42.02 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  41.59 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  44.33 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  40.22 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  40.16 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  39.34 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  37.82 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  40.21 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  38.74 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.71 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  36.97 
 
 		 127 aa  62  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  33.03 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  33.58 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  35.56 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  35.56 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  37.84 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  35.56 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  36.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  36.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  36.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  38.46 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  35.56 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  36.04 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  36.08 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  35.56 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 127 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  35.56 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.17 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  35.35 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  32.88 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  36.36 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  44.29 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  44.29 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  34.51 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  36.21 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  32.58 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  34.45 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.63 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>