More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3942 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 191 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  77.51 
 
 		 209 aa  271  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  52.2 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  40.49 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  42.76 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  37.34 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.34 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  38.51 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  38.29 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  45.45 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  41.96 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  36.31 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  39.86 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 159 aa  104  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  35.03 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  35.8 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  39.22 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  39.86 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  40.3 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  35.76 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 146 aa  95.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  37.78 
 
 		 169 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  39.1 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  37.21 
 
 		 139 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  34.01 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 144 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 144 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 144 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  33.11 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  39.01 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  32.61 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  32.68 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  32.61 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.72 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  31.74 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  31.79 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  33.08 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  36.03 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  31.58 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  33.82 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  33.09 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 		 155 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  37.5 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  37.5 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  37.5 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  37.5 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  30.83 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  36.76 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  41.35 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  30.99 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  31.01 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  33.91 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  32.09 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>