More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4539 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 151 aa  299  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  55 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  54.14 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  50.43 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  55.04 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  50.43 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  48.74 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  45.74 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  45.9 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 181 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  39.71 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  34.35 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  42.52 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  37.21 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.21 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.87 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  31.71 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  35.38 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  36.72 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 		 191 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  33.09 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  34.29 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  34.65 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  32.84 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  32.61 
 
 		 185 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  32.61 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  32.33 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  29.92 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  32.28 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  31.5 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  32.09 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  34.19 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  35.43 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 204 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  31.51 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  31.54 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  32.03 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  33.96 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.45 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.86 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  32.52 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  33.02 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  33.02 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  33.04 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.62 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  31.36 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  29.2 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  30.09 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>