More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0269 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  98.43 
 
 		 127 aa  253  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  97.64 
 
 		 127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  95.28 
 
 		 127 aa  248  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  81.1 
 
 		 127 aa  215  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  77.95 
 
 		 127 aa  208  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  77.95 
 
 		 127 aa  207  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  69.11 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  69.11 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  62.93 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  50.85 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  40.59 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  37.82 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  38.33 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  38.38 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  36.75 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  35.2 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  34.17 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.88 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.88 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.21 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.04 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.9 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.59 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.59 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.59 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  36.9 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.59 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  39.05 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35.83 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.5 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  37.07 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  29.46 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  43.02 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.61 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.23 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.23 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.23 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.23 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.23 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.23 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.23 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  43.02 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  43.02 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  43.02 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  39.76 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  37 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  38 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  34.44 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  27.35 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.84 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.63 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  34.45 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  36.47 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  34.96 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>