266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2007 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  99.26 
 
 		 147 aa  274  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  76.98 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  70.8 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  71.11 
 
 		 148 aa  195  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  63.91 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  63.08 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  64.29 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  58.78 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  55.38 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  49.59 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  49.62 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  51.11 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  50.41 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  48.78 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  49.59 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  47.97 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  47.97 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  47.97 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  45.67 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  42.62 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  40.65 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  36.21 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  40.86 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  40.86 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  32 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.06 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  34.04 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  30.58 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  26.72 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  33.07 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  37.11 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  27.78 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.09 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  35.59 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  32.2 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  31 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  30.47 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  28.57 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  27.59 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  29.82 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  32.48 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  30.19 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>