197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3697 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  78.57 
 
 		 182 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  72 
 
 		 204 aa  270  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  70.11 
 
 		 193 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  67.05 
 
 		 182 aa  239  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  64.94 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  54.6 
 
 		 189 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  51.76 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  60.45 
 
 		 139 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  46.86 
 
 		 189 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  42.77 
 
 		 179 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  45.27 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  45.52 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  38.75 
 
 		 169 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  47.59 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  44.59 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  42.66 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  40.54 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  42.45 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 146 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  41.78 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  40.88 
 
 		 142 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  42.34 
 
 		 145 aa  117  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  41.45 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  41.45 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  41.91 
 
 		 145 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  41.91 
 
 		 145 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  41.91 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 145 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  44.12 
 
 		 145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 144 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 144 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 144 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  39.86 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  41.18 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  38.3 
 
 		 146 aa  104  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  44.85 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  37.86 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  44.85 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  44.85 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  44.85 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  44.85 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  45.19 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  44.12 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 225 aa  97.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  36.09 
 
 		 209 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  42.42 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.76 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.15 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  35.65 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.93 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.93 
 
 		 135 aa  62  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.07 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  26.12 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  29.32 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3386  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.220189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  33.71 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 133 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 126 aa  51.6  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 138 aa  51.2  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  30.61 
 
 		 132 aa  51.2  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  41.33 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>