280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1117 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  53.73 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  55.38 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  47.54 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  46.43 
 
 		 146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  48.2 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  44.92 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  43.7 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  44.03 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  47.83 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  45.31 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  43.75 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  47.15 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  39.71 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  42.97 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  41.73 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  41.94 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  45.19 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  35.56 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  43.59 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 169 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.13 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  34.51 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  34.45 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  38.94 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  35.45 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  37.1 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 166 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.4 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.4 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.4 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.4 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  35.4 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.4 
 
 		 374 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.4 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  34.26 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.71 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  41.57 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.86 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  37.39 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  37.17 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  29.06 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.94 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.94 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  32.54 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.94 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.94 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.21 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  31.75 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  35.05 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  30.08 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>