160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0974 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 140 aa  286  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  59.85 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  55.8 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  44.55 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  41.32 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  40.32 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  40.83 
 
 		 185 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  42.74 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  40.5 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  39.67 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  39.67 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  39.67 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  38.14 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  41.82 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  36.51 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  38.02 
 
 		 177 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  38.02 
 
 		 177 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  38.02 
 
 		 177 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  38.02 
 
 		 147 aa  83.6  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  38.02 
 
 		 238 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  38.02 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  38.02 
 
 		 374 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  37.27 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  33.88 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  38.53 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  39.09 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  32.62 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  31.21 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  35.59 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  34.97 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  36.79 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.83 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  39.34 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  31.36 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  30.93 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  35.24 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  31.54 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  28.43 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  29.82 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  36.17 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  29 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  32.82 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  29 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  30 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  27.34 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  38.52 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  28.85 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  34.94 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.26 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  29.77 
 
 		 160 aa  48.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  29.31 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  29.77 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  32.94 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  29.81 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  31.39 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  33.08 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  42.11 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>