More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2211 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  42.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  32.54 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  34.71 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  32.82 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30.95 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  33.08 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  32.26 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  30.71 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  32 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  32.77 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  30.77 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.03 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  27.78 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  32.14 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  28.35 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.15 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  32.86 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  27.56 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
191 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  29.27 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  30.08 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  27.56 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  32.14 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  33.61 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  28.47 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  28.46 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  30.17 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  28.1 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  28.23 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  25.69 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  28.79 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  28.7 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  28.23 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  25.22 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.12 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  29.09 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  32.14 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
154 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  31.45 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
176 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  26.17 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  27.97 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  27.97 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  27.97 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  27.97 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2825  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249346  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  27.97 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  27.41 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  27.97 
 
 
155 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>