171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0264 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
142 aa  292  9e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  53.79 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  59.09 
 
 
147 aa  161  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  40.91 
 
 
138 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  39.81 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  32.77 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  37.86 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  27.56 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.17 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.07 
 
 
161 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.77 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  32.17 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  26.92 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  29.46 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  28.95 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  29.03 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  29.03 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  26.12 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  26.89 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  26.89 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  24.04 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  26.89 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  26.89 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  26.89 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  26.89 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  26.89 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  26.89 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  26.89 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  28.69 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  26.05 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  26.05 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  26.05 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  28.45 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  29.36 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  27.69 
 
 
157 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  25.21 
 
 
144 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  26.23 
 
 
138 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  28.21 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  32.71 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  27.13 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  28.7 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  22.81 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  24.81 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  29.03 
 
 
176 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  23.73 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  24.07 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  29.17 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>