98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2936 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 143 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  64.03 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 		 156 aa  159  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  64.03 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  57.66 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  58.7 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  57.66 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  57.66 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  56.2 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  56.2 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  62.59 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  62.14 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  54.48 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  57.14 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  56.39 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  55.64 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  56.43 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  52.17 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  52.99 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  51.49 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  53.24 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  52.9 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  49.62 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  50.37 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  49.63 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  49.63 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  56.69 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  56.69 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  51.11 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  49.64 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  45.99 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  44.53 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  44.29 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  42.34 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  47.32 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  41.51 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  36.7 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  36.7 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  36.7 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  37.38 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  34.86 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  36.7 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  36.7 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  36.7 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  37.61 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  36.7 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  36.7 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  36.7 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  36.7 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  31.39 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  30.88 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  29.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  31.08 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.07 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  31.07 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  26.04 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  29.46 
 
 		 161 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  36.47 
 
 		 148 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  34.31 
 
 		 140 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 135 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  28.79 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  30.7 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  28.07 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  30.59 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  26.44 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  26.5 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  25.96 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 204 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>