81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1283 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 147 aa  299  7.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 		 143 aa  139  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  53.1 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  41.01 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  42.57 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  42.65 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  37.96 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  40.44 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  37.04 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  38.69 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  44.78 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  44.78 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  42.25 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  41.3 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  41.61 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 152 aa  93.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  39.26 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  45.28 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  37.96 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  37.69 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  45.19 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  35.77 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  39.23 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  38.24 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  33.57 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  45.63 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  34.65 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  39.29 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  39.29 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  32.58 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  32.41 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  32.41 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  32.41 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  32.41 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  31.48 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  31.48 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  31.48 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  28.16 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  30.56 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  32.18 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  30.17 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  24.47 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  24.47 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.99 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  30.19 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 		 135 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  31.13 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  26.88 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  28.33 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 149 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>