95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3960 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
142 aa  286  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  77.3 
 
 
149 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  76.6 
 
 
143 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  75.89 
 
 
143 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 
145 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  56.52 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  57.25 
 
 
169 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  64.54 
 
 
145 aa  158  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  65.25 
 
 
145 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  57.97 
 
 
156 aa  156  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  55.32 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  53.9 
 
 
142 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  52.48 
 
 
142 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  52.71 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  57.45 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  52.48 
 
 
142 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  56.74 
 
 
148 aa  137  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  54.96 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  49.65 
 
 
143 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  55.22 
 
 
140 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  52.11 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  54.35 
 
 
141 aa  129  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  57.04 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  50.74 
 
 
142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  50.36 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  53.49 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  52.24 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  49.28 
 
 
139 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  51.94 
 
 
138 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  51.82 
 
 
141 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  48.46 
 
 
140 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  53.17 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  53.17 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  51.09 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  48.91 
 
 
152 aa  114  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  44.93 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  54 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 
147 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 
137 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  47.79 
 
 
135 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 
143 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  33.82 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  33.64 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  33.64 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  36.27 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  33.33 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  33.33 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  30.71 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
154 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  34.52 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 
154 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  30.66 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  35.23 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.93 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.93 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  29.79 
 
 
138 aa  44.3  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  31.82 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  32.95 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  33.91 
 
 
193 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04950  uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism  38.24 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  32.14 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
135 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>