102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1717 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  276  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  67.69 
 
 
151 aa  191  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  63.7 
 
 
139 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  65.38 
 
 
137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  68.42 
 
 
138 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  66.92 
 
 
138 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  66.92 
 
 
137 aa  168  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  57.78 
 
 
141 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  56.39 
 
 
145 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  59.42 
 
 
169 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  54.81 
 
 
142 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  49.24 
 
 
140 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  50.38 
 
 
143 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  49.62 
 
 
140 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  50 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  51.15 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  45.8 
 
 
140 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  50.76 
 
 
142 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  50.76 
 
 
142 aa  123  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  48.87 
 
 
141 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  49.61 
 
 
135 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  51.56 
 
 
140 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  57.35 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  56.62 
 
 
143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  56.3 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  49.19 
 
 
141 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  49.19 
 
 
141 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  57.04 
 
 
142 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  51.06 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  51.08 
 
 
145 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  42.42 
 
 
135 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  43.8 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  46.43 
 
 
135 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  49.24 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  48.48 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 
147 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  37.04 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  37.04 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  37.04 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  37.72 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  34.88 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  37.04 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  34.26 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  34.26 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  35.19 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  37.27 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  34.26 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  34.26 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  34.26 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  34.26 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  34.26 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
153 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.85 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.85 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.85 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.85 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  35.85 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  30.36 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.85 
 
 
248 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  40.18 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  38.32 
 
 
374 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.81 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.96 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.96 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.96 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  31.19 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  26.09 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  39.36 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.94 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  30.15 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.94 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
140 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  24.72 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  26.61 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  32.08 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>