95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0147 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  89.66 
 
 		 145 aa  238  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  66.2 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  62.59 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  65.25 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  59.29 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  59.4 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  55.4 
 
 		 169 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  52.86 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  56.39 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  49.63 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  52.17 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  63.81 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  63.81 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  51.08 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  51.06 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  50 
 
 		 139 aa  129  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  49.26 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  50.35 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  51.94 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  50 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  51.94 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  50.39 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  53.03 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  45.99 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  48.23 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  48.53 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  52.48 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  52.48 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  52.25 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  50.45 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  53 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 147 aa  103  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  38.41 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  38.24 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  36.76 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  38.97 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  37.04 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  35.29 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  35.29 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  36.03 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  35.29 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  39.81 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  39.81 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  33.94 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  34.86 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  39.24 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  27.2 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  48.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  27.43 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  31.52 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  26.6 
 
 		 142 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 155 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  25.17 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  29.2 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  24.82 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  27.96 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  30.83 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  25.19 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  22.7 
 
 		 150 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>