105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1603 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  63.57 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  60.14 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  60.71 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  69.11 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  69.11 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  62.69 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  55.64 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  51.43 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  59.4 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  49.26 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  51.94 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  51.45 
 
 		 152 aa  126  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  48.53 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  50.77 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  48.53 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  57.89 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  45.07 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  51.56 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  47.06 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  49.24 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  47.62 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  53.49 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  54.96 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  53.49 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  46.88 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  46.09 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  47.69 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  42.11 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  43.75 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  37.78 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  27.93 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  30.84 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  30.84 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  30.84 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  30.84 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  30.84 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  30.84 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  30.84 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  30.56 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  31.78 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  30.84 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  30.84 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  30.7 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  34.86 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  29.91 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  29.41 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  34.21 
 
 		 134 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  30.28 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  29 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.68 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  31.51 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.82 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  33 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  31.19 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  28.91 
 
 		 193 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.19 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.87 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  29.73 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  25.25 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.87 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.87 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.87 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  28.36 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  31.63 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  43.08 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  31.63 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>