117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0580 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  96.77 
 
 
134 aa  245  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 
151 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  44.33 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
141 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  38.1 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  32.79 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  37.89 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  39.09 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  37.11 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  30.08 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
173 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  28.93 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  27.27 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
139 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  36.11 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 
159 aa  48.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  30.4 
 
 
169 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.21 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
209 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  31.67 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  36.46 
 
 
144 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  31.25 
 
 
127 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
216 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  30 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.06 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  31.5 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  31.58 
 
 
318 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  30.09 
 
 
316 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>