59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5730 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
152 aa  303  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  52.55 
 
 
140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  53.28 
 
 
142 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  53.62 
 
 
142 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  51.45 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  51.82 
 
 
143 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  52.17 
 
 
142 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  51.09 
 
 
142 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  45.99 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  49.64 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  50.38 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  46.27 
 
 
156 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  45.99 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  46.67 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  44.78 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 
149 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  45.52 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  46.32 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  47.33 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  41.43 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  44.62 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  44.96 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  48.44 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  40 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  48.91 
 
 
142 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  53.85 
 
 
141 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  53.85 
 
 
141 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  41.04 
 
 
135 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  40.3 
 
 
135 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
145 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
145 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  40.88 
 
 
140 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
137 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  44.78 
 
 
148 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  44.78 
 
 
148 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
147 aa  93.6  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  30.37 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  30.65 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  30 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.78 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
135 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  24.34 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  29.36 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  30.59 
 
 
135 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 
155 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>