75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3834 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  274  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  274  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  95.04 
 
 		 141 aa  265  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  64.29 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  63.57 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  57.45 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  54.48 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  54.62 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  55.07 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  52.11 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  50.38 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  56.83 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  56.12 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  48.53 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  47.79 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  49.26 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  50 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  56.3 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  54.62 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  47.06 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  48.06 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  47.79 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  53.85 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  56.39 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  45.45 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  46.32 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  63.81 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  46.62 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  45.38 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  45.38 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  41.43 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  38.57 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  41.48 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  32.38 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  32.38 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  32.38 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  32.38 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  32.38 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  32.38 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  32.38 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  32.38 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  32.38 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  32.38 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  32.38 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  30.59 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  30.97 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  29.13 
 
 		 141 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  29.13 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  32.69 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>