More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2142 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  285  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 146 aa  147  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  52.99 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  52.59 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.59 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  35.59 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.21 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  34.75 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  32.52 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.83 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.65 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  28.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  31.62 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  28.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  31.19 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  28.1 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  38.46 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  32.74 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  32.74 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  35.56 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  32.74 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  32.77 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  32.67 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  31.37 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  31.37 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  31.37 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  27.97 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  31.37 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  28.7 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  27.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  28.7 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  27.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  27.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  27.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  27.03 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  27.03 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  27.03 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  27.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  26.09 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  35.87 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  26.09 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  30.39 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  26.09 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  34.57 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  28.7 
 
 		 374 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  29.31 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  29.1 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.17 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 232 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  31.37 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.37 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  26.09 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  31.3 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  27.34 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  32.48 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>