111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2032 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
135 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  250  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  250  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  71.09 
 
 
128 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  72.66 
 
 
128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  43.28 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.6 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  32.74 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  30.4 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  30.4 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  30.4 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  41.67 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.98 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.65 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
232 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
189 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
213 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.1 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  40.54 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  31.58 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  32.05 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  30.3 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  38.16 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  30.3 
 
 
150 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
127 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
147 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  30.1 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  31.48 
 
 
179 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  32.14 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  43.33 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
140 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  33.64 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  34.34 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  32.5 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  37.5 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  31.97 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  31.18 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  29.66 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  28.3 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7775  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  26.36 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  29.9 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  30.1 
 
 
145 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  35.53 
 
 
187 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
136 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 
122 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  35.53 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  28.71 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  31.3 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>