250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2953 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 144 aa  296  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  94.37 
 
 		 144 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  78.01 
 
 		 152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  77.21 
 
 		 147 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  75.74 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  75.74 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  75.74 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  75.74 
 
 		 147 aa  229  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  75.74 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  75.74 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  74.82 
 
 		 374 aa  226  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  74.82 
 
 		 248 aa  225  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  73.76 
 
 		 238 aa  224  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  74.82 
 
 		 177 aa  223  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  74.82 
 
 		 177 aa  223  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  74.82 
 
 		 177 aa  223  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  74.82 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  55.15 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  52.31 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  51.13 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  45.16 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  52.59 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 		 166 aa  104  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 		 213 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  40.32 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  35.88 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  34.35 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  36.92 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  39.25 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  35.11 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  38.53 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  35.2 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  37.72 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  36.28 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.71 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  32.58 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  32.58 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  32.84 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  31.85 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  36.27 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  28.8 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  31.43 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  37.1 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  32.11 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.5 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  35.83 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  27.94 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  31 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  35.34 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  35.25 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  34.09 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  26.83 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  33.04 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  31.67 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.58 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  35.9 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>