275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1180 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  309  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  66 
 
 
153 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  55.78 
 
 
147 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  56.46 
 
 
147 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  55.1 
 
 
147 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  55.73 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
154 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  46.04 
 
 
154 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  46.21 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
155 aa  83.6  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  36.79 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.08 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.75 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.25 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.25 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  34.65 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  34.65 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  34.65 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  29.23 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  32.77 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.37 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.15 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  35.8 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  29.75 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  29.41 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  30.08 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.1 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  35.96 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  38.37 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.63 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  34.19 
 
 
132 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  28.33 
 
 
135 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  35.96 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  29.91 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
155 aa  50.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  38.37 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  29.75 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
132 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
233 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  28.04 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  41.05 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  29.85 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  33.72 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  30.84 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  30.84 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2156  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  29.91 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  28.16 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  35.8 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  28.93 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  32.5 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.69 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  28.16 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.29 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>