123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2706 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  36.13 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  43.21 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.54 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  38.2 
 
 		 191 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  29.03 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  23.97 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.1 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  31.15 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  30.63 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  25.62 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  29.1 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  29.82 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  32.98 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  25.62 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  23.24 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  23.24 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  23.24 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  23.24 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.84 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  33.04 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  30.84 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  23.24 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  23.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  30.38 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  23.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  24.17 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  23.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  23.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  23.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  23.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  23.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 138 aa  47.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  23.93 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  24.24 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  24.24 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  24.24 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  28.95 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  27.72 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  27.05 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  22.5 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  27.43 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  25.18 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  25.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  25.71 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  24.19 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  23.48 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  26.02 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  27.59 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 304 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  24.58 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  22.88 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  31.71 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>