115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2434 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  328  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  50.37 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  38.67 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  39.68 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  39.1 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  33.1 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  35.35 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  34.01 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  37.74 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  31.51 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  38.55 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  36.15 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  30.41 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  28.89 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  27.94 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  33.04 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  40.24 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  30.85 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  26.71 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 237 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  30.12 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  31 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  30.25 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  29.51 
 
 		 661 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  38.2 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.09 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  28.81 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  31.17 
 
 		 226 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  29.41 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.129639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  28.26 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  28.09 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 159 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  33.87 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>