84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2166 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
190 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  48.81 
 
 
179 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
169 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
169 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
170 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 
170 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  41.43 
 
 
184 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  39.72 
 
 
179 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
182 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  37.16 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  35.46 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  38.04 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
136 aa  61.6  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  30.7 
 
 
220 aa  61.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
225 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
131 aa  58.2  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  32.62 
 
 
211 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
237 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  30.82 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
156 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
157 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
136 aa  51.2  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  30.43 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  29.68 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  30.43 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  31.19 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  28.89 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 
256 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  34.83 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
150 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
153 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  25.71 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11106  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02390)  34.04 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
216 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  28.26 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
166 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31999  predicted protein  23.21 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.25 
 
 
153 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  27.74 
 
 
166 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  27.4 
 
 
165 aa  45.1  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  30.09 
 
 
156 aa  45.1  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
153 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
135 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
158 aa  44.7  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  26.89 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  32.5 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  21.1 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  21.1 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  31.58 
 
 
318 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  25.96 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
161 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
219 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
159 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
214 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>