50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2556 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  82.49 
 
 
216 aa  353  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  74.24 
 
 
208 aa  300  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  74.24 
 
 
208 aa  300  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  73.74 
 
 
208 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  46.28 
 
 
218 aa  150  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  42.44 
 
 
209 aa  141  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
215 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
215 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
215 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  41.97 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3859  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0568373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  38.54 
 
 
210 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4059  thioesterase superfamily protein  37.97 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.565547  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 
162 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  29.57 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
162 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
165 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2595  hypothetical protein  29.93 
 
 
155 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000992118  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  30.47 
 
 
318 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  27.89 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  32.26 
 
 
124 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  32.26 
 
 
134 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  34.86 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  33.7 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  37.04 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  30.69 
 
 
316 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  26.7 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  26.7 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  26.7 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01747  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08890)  29.91 
 
 
271 aa  42  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  30.33 
 
 
262 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>