113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1139 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  54.59 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  42.93 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  36.87 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  37.02 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  40.12 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  37.99 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  39.56 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  40.36 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  38.14 
 
 		 262 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  37.36 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  44.09 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  30.05 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 		 165 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  32.07 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  32.07 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  44.32 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  37.17 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  39.78 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3856  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  35.43 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  35.43 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  31.53 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  37.74 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  33.86 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  36.73 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  32.98 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  28.65 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  34.34 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  37.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  31.06 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01747  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08890)  32.99 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  29.1 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00181  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 		 317 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  30.58 
 
 		 144 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 166 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  26.87 
 
 		 166 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 167 aa  48.9  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 143 aa  48.5  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  22.96 
 
 		 316 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  31.19 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  29.25 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 136 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  23.93 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  29.25 
 
 		 165 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  33 
 
 		 132 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3859  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0568373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  29.25 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 151 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>