65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2352 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
150 aa  309  6.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  60.78 
 
 
153 aa  177  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  53.74 
 
 
154 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  51.35 
 
 
159 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 
157 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  45.75 
 
 
166 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  50.68 
 
 
156 aa  154  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  49.36 
 
 
160 aa  150  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  48.68 
 
 
161 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 
159 aa  149  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  44.72 
 
 
165 aa  140  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  41.29 
 
 
165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  42.95 
 
 
158 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 
164 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  39.69 
 
 
170 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 
151 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 
151 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
158 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  45.83 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  42.34 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  46.67 
 
 
166 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  45 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  41.04 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  36.59 
 
 
104 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  57.38 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  35.48 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
204 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
170 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  38.64 
 
 
220 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
190 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  31.3 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 
226 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  30.77 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 
179 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
237 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  28.12 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  36.71 
 
 
318 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.91 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  29.17 
 
 
226 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>