86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1445 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 204 aa  403  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  51.76 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  55.69 
 
 		 184 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  51.57 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  49.09 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  34.94 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  37.16 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  39.56 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  29.94 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 		 165 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  34.75 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  32.67 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  38.2 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  32.67 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  30.16 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  40.86 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  32 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  32.43 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 131 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  32.77 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  33.64 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 164 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  27.68 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  29.06 
 
 		 165 aa  48.5  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  30.14 
 
 		 157 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  31.09 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  35.87 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  30 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  30.48 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11106  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02390)  33.7 
 
 		 266 aa  44.7  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  26.06 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  30.69 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.65 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  25.56 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 214 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 161 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>