64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6840 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 151 aa  313  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  88.74 
 
 		 151 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  48.34 
 
 		 165 aa  149  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  54.05 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  45.64 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  46.98 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  48.3 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  47.4 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  48.18 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  46.26 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  43.79 
 
 		 164 aa  130  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  41.78 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  39.07 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  44.26 
 
 		 166 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  41.46 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  39.57 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  40.65 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  37.59 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  33.56 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  30.41 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  43.08 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  29.93 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  25.17 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  35.51 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  29.09 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  29.17 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 225 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  27.27 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  32.43 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3859  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0568373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  26.35 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  31.3 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  41.82 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  30.87 
 
 		 214 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  37.25 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  22.88 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4059  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 239 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.565547  normal  0.774501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>