118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0327 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
136 aa  277  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  49.23 
 
 
134 aa  143  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 
136 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 
146 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 
131 aa  110  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 
143 aa  87  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  42.28 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  42.59 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  35.11 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  29.13 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  34.68 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  39.36 
 
 
226 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  44.32 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
204 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  44.32 
 
 
175 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
179 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  40.91 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  33.83 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  33.7 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  30.07 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  30.41 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  35.96 
 
 
318 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
165 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
179 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
190 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
193 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
193 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
193 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  29.37 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
189 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  31.86 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  29.58 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  31.53 
 
 
170 aa  48.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  29.58 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 
210 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  30.39 
 
 
220 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
203 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
226 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11106  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02390)  32.2 
 
 
266 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
328 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.1 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  28.16 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01747  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08890)  30.58 
 
 
271 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  28.69 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
327 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34276  predicted protein  30.93 
 
 
224 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.021374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  24.3 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.87 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.36 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
208 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
158 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>