99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1367 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
162 aa  335  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  95.03 
 
 
165 aa  320  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  69.75 
 
 
162 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  75.51 
 
 
164 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  68.52 
 
 
162 aa  229  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  41.58 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  41.58 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  41.58 
 
 
208 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  36.73 
 
 
220 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 
225 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
208 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 
226 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 
204 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  35.48 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  34.29 
 
 
203 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 
209 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
256 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
210 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
233 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
233 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  35.16 
 
 
318 aa  55.1  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
239 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  38.04 
 
 
262 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
216 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
208 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  29.36 
 
 
184 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  32.32 
 
 
316 aa  50.8  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  34.38 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  30.21 
 
 
238 aa  47.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.129639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
179 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  37.36 
 
 
182 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  33.73 
 
 
210 aa  47.4  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  34.18 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
164 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
146 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  30.84 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  27.05 
 
 
140 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  31.46 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  27.19 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  34.94 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34276  predicted protein  27.88 
 
 
224 aa  45.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.021374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  30.77 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  27.45 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  22.83 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.58 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01747  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08890)  29.17 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
214 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  26.73 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  27.38 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  27.38 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  27.38 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  27.38 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  27.38 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  27.38 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  26.97 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 
137 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  28.57 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
215 aa  40.8  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  28.57 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  28.57 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  28.57 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  28.57 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  28.57 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  28.57 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  26.73 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  28.57 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  32.61 
 
 
144 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4059  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 
239 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.565547  normal  0.774501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>