71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0967 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  37.02 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  35.67 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  35.57 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  42.59 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  32.93 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  33.13 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  33.13 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  34.58 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  34.02 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  39.36 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  27.33 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  30.53 
 
 		 318 aa  51.6  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  31 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  37.36 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  33.72 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  27.35 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  27.97 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  34.07 
 
 		 301 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  26.24 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34276  predicted protein  35.38 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.021374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  25.53 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  32.63 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  26.19 
 
 		 238 aa  44.3  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.129639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  36.23 
 
 		 316 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  30.32 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.56 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  26.76 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  25.53 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  25.36 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  21.57 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  34 
 
 		 226 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 304 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 157 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 156 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>