55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2628 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  83.26 
 
 
239 aa  394  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 
237 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  35.84 
 
 
226 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  39.9 
 
 
208 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  37.82 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  39.88 
 
 
203 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  35.52 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  37.91 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  32.62 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
210 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  34.76 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3856  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
182 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  34.43 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 
204 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  30.52 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  38.36 
 
 
164 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
162 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
150 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
164 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  29.69 
 
 
188 aa  55.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  41.67 
 
 
184 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  34.11 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  34.11 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
146 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 
162 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  28.65 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 
190 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  27.78 
 
 
170 aa  48.9  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  27.23 
 
 
318 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  25.93 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  38.71 
 
 
144 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  43.1 
 
 
661 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
175 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
169 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
169 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 
210 aa  42.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>