74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0260 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
162 aa  332  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  76.07 
 
 
164 aa  258  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  80.25 
 
 
162 aa  253  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  69.75 
 
 
162 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  70.19 
 
 
165 aa  241  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  44.32 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  40.26 
 
 
237 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
208 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
219 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 
226 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
225 aa  57.4  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  34.83 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  34.83 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  35.29 
 
 
262 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
209 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  34.83 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
229 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 
256 aa  51.6  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
233 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
210 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
233 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
239 aa  50.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  38.46 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  34.88 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  36.14 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  31.25 
 
 
318 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  32.94 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 
216 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  30.84 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
182 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  33.72 
 
 
215 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
204 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
214 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  32.43 
 
 
316 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  28.3 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  26.88 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  27.83 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4059  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
239 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.565547  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
193 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
193 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
193 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
218 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3859  thioesterase superfamily protein  30.86 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0568373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  31.52 
 
 
209 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
156 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  23.26 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  28.21 
 
 
189 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  29.33 
 
 
136 aa  41.2  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 
227 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  25.17 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>