50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3859 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3859  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0568373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  58.25 
 
 
209 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
214 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
215 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
215 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  50.25 
 
 
215 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
215 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  48.54 
 
 
210 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 
208 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 
208 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  42.08 
 
 
208 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 
216 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  43.17 
 
 
189 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 
209 aa  131  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  36.46 
 
 
218 aa  117  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4059  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.565547  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  30.32 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2595  hypothetical protein  38.78 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000992118  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  31.22 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  29.26 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  27.96 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  30.09 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 
164 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  29.07 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 
162 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  28.93 
 
 
316 aa  52.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  27.22 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  30.19 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  27.23 
 
 
239 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  27.47 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
189 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 
162 aa  48.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  29.83 
 
 
227 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  27.93 
 
 
184 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
193 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 
146 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
193 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
193 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  26.87 
 
 
318 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 
151 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01747  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08890)  28.33 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  33.71 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>