87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1989 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  45.7 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  44.22 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  42.93 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 
208 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  38.59 
 
 
210 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  38.59 
 
 
233 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  38.59 
 
 
233 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  36.45 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  36.68 
 
 
208 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 
237 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3856  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  39.55 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  38.42 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  42.97 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  37.95 
 
 
239 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
256 aa  84  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  37.5 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  34.43 
 
 
170 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  33.86 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
170 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
170 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 
169 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  39.78 
 
 
169 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
190 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
170 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  36.46 
 
 
179 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  38.54 
 
 
318 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
136 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
131 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  31.16 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  31.16 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
164 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  31.16 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
134 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
165 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  35.48 
 
 
209 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  27.91 
 
 
142 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  28.49 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  28.49 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  28.49 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  32.94 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
136 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
144 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
144 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
144 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01747  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08890)  34.34 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
132 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  33.72 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  34.41 
 
 
146 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  30.25 
 
 
156 aa  46.2  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
227 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11106  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02390)  31.5 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  30.98 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  29.09 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  28.95 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
131 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  34.04 
 
 
188 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  28.1 
 
 
142 aa  41.2  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>