81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1636 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  53.93 
 
 
184 aa  190  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  52.2 
 
 
204 aa  173  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  51.27 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 
182 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  39.72 
 
 
190 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
182 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  42.36 
 
 
170 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  42.36 
 
 
170 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  36.48 
 
 
169 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  36.48 
 
 
169 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  39 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  32.76 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
136 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
256 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  30.71 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
131 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
239 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
131 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  28.08 
 
 
167 aa  52  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
136 aa  52  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
157 aa  51.2  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  31.62 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  30.14 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  29.45 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
210 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  28.48 
 
 
170 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
219 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  31.58 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  29.66 
 
 
170 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  28.77 
 
 
165 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  30.1 
 
 
226 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  31.13 
 
 
318 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  36.47 
 
 
208 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  36.47 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  36.47 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  33.03 
 
 
316 aa  44.3  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  34.02 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  26.14 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  28.21 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
153 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
135 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  42.67 
 
 
216 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  32 
 
 
203 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
145 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>