66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4288 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
229 aa  453  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 
233 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 
233 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  56.5 
 
 
208 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  55.34 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  54.85 
 
 
209 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  56.22 
 
 
208 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  53.88 
 
 
219 aa  191  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  50.78 
 
 
203 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3856  thioesterase superfamily protein  52.5 
 
 
213 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 
193 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 
193 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 
193 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  53.93 
 
 
189 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  46.35 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  46.7 
 
 
211 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  37.99 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  35.27 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  38.99 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  31.98 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  36.09 
 
 
262 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  34.54 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  35.16 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  31.38 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  33.16 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  32.2 
 
 
316 aa  56.6  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  39.6 
 
 
215 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  39.6 
 
 
215 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  27.83 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.129639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
162 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  27.03 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
136 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 
164 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
165 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  39.56 
 
 
164 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 
162 aa  51.6  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01747  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08890)  32.2 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  36.08 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  27.89 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11106  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02390)  32.43 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  41.82 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3859  thioesterase superfamily protein  29.26 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0568373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
146 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  35.05 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
132 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
169 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  35.8 
 
 
170 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
169 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
204 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 
170 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  33.7 
 
 
170 aa  42  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>