57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5897 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  37.58 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  38.14 
 
 
220 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  31.87 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  32.93 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
203 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
164 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3856  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
208 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 
162 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
208 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
208 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  35.25 
 
 
209 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  33.02 
 
 
215 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  33.02 
 
 
215 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  33.02 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
165 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 
162 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
146 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
215 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
216 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
169 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
169 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
170 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
170 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
215 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
170 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  35.19 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  34 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
150 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
131 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  29.75 
 
 
209 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
209 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  29.31 
 
 
140 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>