80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4580 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
170 aa  339  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  97.65 
 
 
170 aa  333  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  97.65 
 
 
170 aa  333  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  78.31 
 
 
169 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  78.31 
 
 
169 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  45.93 
 
 
179 aa  111  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  39.02 
 
 
184 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  42.36 
 
 
179 aa  97.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  33.13 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
136 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  29.8 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  32.93 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  42.71 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  35.19 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 
225 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  30.61 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  34.44 
 
 
226 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
136 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  37.74 
 
 
211 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
223 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  34.83 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
208 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
208 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
208 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  29.09 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  36.47 
 
 
144 aa  51.6  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  29.09 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
219 aa  50.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  28.48 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 
131 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  27.78 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
233 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
233 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
210 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  30.25 
 
 
262 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  25.17 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  27.06 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  30.83 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  28.71 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  27.27 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  26.49 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
237 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
153 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
144 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
218 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 
229 aa  41.2  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  30.16 
 
 
200 aa  41.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  33.68 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>