39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1101 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  89.06 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  79.69 
 
 		 156 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  70.97 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  72.58 
 
 		 166 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  67.19 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  64.06 
 
 		 159 aa  95.5  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  67.74 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  65.62 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  57.35 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  54.93 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  60.66 
 
 		 158 aa  85.5  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  59.02 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  57.38 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  50.75 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  94.12 
 
 		 104 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  43.08 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  43.08 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 136 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  42.31 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  35.19 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  42.31 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  33.8 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  42.31 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  42.31 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  40.38 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  33.87 
 
 		 156 aa  41.6  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>