68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1174 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  100 
 
 
165 aa  348  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 
166 aa  167  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  46.71 
 
 
154 aa  161  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  46.05 
 
 
156 aa  158  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  49.37 
 
 
159 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  43.21 
 
 
165 aa  151  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  44.37 
 
 
157 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  48.34 
 
 
151 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  42.76 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  46.36 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  46.75 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  39.61 
 
 
161 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  41.06 
 
 
158 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  41.29 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
159 aa  114  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  39.86 
 
 
170 aa  111  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  41.48 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  41.84 
 
 
165 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  34.39 
 
 
158 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  42.97 
 
 
166 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  41.13 
 
 
165 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  40.43 
 
 
165 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  36.91 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  35.57 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 
157 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  50.75 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  40.21 
 
 
225 aa  61.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  32.17 
 
 
188 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  35.11 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 
226 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  37.37 
 
 
220 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  36.15 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
157 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
204 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  25.53 
 
 
131 aa  47.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
182 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  27.33 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  27.21 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 
190 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  28.16 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  28.16 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  28.16 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  29.46 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  31.11 
 
 
318 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 
136 aa  40.8  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
223 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  32.5 
 
 
238 aa  40.8  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.129639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  25.17 
 
 
162 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>