41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1097 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
159 aa  331  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  47.02 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  35.9 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  44.37 
 
 
151 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  36.18 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  39.62 
 
 
159 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  33.96 
 
 
165 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 
166 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 
156 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 
161 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  37.58 
 
 
160 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
157 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  37.91 
 
 
159 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  33.55 
 
 
154 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
150 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  33.95 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  39.1 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
153 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  32.28 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  34.29 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  32.24 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  34.29 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  34.78 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  32.61 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  29.75 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  26.4 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  35.38 
 
 
200 aa  47.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
225 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  24.29 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  28.3 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>